远紫外区的CD光谱主要反映肽键的圆二色性。在蛋白质或肽的规则二级结构中，肽键排列高度规则。其排列方向决定了肽键能级跃迁的分裂。不同二级结构的蛋白质或肽产生的CD带的位置和吸收强度是不同的。因此，根据被测蛋白质或多肽的远紫外CD光谱，可以获得蛋白质或多肽链的二级结构信息，从而揭示蛋白质或多肽的二级结构。
近紫外圆二色光谱分析
如果没有明确三维结构的蛋白质虽然保留了二级结构，则近紫外区域的信号将几乎为零。另一方面，如果蛋白质折叠成明确的结构，则会出现显着的近紫外信号。由于蛋白质-蛋白质相互作用或溶剂条件变化而导致的三级结构的微小变化可以通过灵敏的近紫外 CD 光谱检测到。
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